Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms