Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA2Q15822 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA2Q15822 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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