Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ALX1Q15699 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ALX1Q15699 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ALX1Q15699 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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