Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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