Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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