Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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