Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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