Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GPS1Q13098 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GPS1Q13098 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GPS1Q13098 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GPS1Q13098 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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