Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CHD3Q12873 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CHD3Q12873 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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