Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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