Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BPTFQ12830 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BPTFQ12830 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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BPTFQ12830 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BPTFQ12830 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BPTFQ12830 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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BPTFQ12830 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BPTFQ12830 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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