Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms