Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TWF1Q12792 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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