Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAPQ12770 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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