Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms