Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms