Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms