Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC125618.1-201ENST00000472596 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PRSS58-202ENST00000552471 1123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ITGA9-AS1-211ENST00000594579 670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF826P-204ENST00000597334 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNB1Q02641 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC02505-201ENST00000505298 788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RN7SKP135-201ENST00000516549 247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC034198.2-201ENST00000606447 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms