Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR4P57081 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR4P57081 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.2 ms