Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB3P54753 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms