Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms