Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXD13P35453 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXD13P35453 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXD13P35453 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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