Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZBED1O96006 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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