Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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