Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFS4O43181 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms