Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLGNO14967 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLGNO14967 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLGNO14967 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms