Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms