Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms