Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SOBPA7XYQ1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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