Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GOLGA6BA6NDN3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms