Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms