Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms