Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD8Q9NX08 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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