Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GKN1Q9NS71 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms