Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BPIFA1Q9NP55 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms