Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG0

B3GNT5, Lactosylceramide 1,3-N-acetyl-beta-D-glucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT5Q9BYG0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
B3GNT5Q9BYG0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms