Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
C9orf16Q9BUW7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C9orf16Q9BUW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms