Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIC2Q96JB3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms