Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KCTD12Q96CX2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms