Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PIK3C3Q8NEB9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms