Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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TTC21AQ8NDW8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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TTC21AQ8NDW8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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TTC21AQ8NDW8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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TTC21AQ8NDW8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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TTC21AQ8NDW8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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TTC21AQ8NDW8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTC21AQ8NDW8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTC21AQ8NDW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTC21AQ8NDW8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTC21AQ8NDW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TTC21AQ8NDW8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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