Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TTLL9Q3SXZ7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTLL9Q3SXZ7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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