Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms