Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN3Q16667 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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