Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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GABRA6Q16445 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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