Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLR1Q15399 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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