Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLD3Q15054 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms