Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NCAPHQ15003 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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NCAPHQ15003 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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NCAPHQ15003 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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