Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms