Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTR4Q13639 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms